Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM17Q96I25 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms