Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
BCANQ96GW7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
BCANQ96GW7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms