Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC11Q96DB2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC11Q96DB2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC11Q96DB2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms