Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB7BQ96AH8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms