Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRIM52Q96A61 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM52Q96A61 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRIM52Q96A61 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms