Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBE2E3Q969T4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3Q969T4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms