Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN3Q969G5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms