Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC9Q92623 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC9Q92623 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC9Q92623 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC9Q92623 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC9Q92623 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC9Q92623 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC9Q92623 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC9Q92623 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC9Q92623 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC9Q92623 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC9Q92623 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC9Q92623 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC9Q92623 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC9Q92623 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC9Q92623 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC9Q92623 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC9Q92623 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC9Q92623 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTC9Q92623 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTC9Q92623 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC9Q92623 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC9Q92623 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC9Q92623 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC9Q92623 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC9Q92623 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC9Q92623 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC9Q92623 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC9Q92623 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC9Q92623 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC9Q92623 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC9Q92623 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC9Q92623 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC9Q92623 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC9Q92623 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC9Q92623 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC9Q92623 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC9Q92623 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC9Q92623 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC9Q92623 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC9Q92623 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC9Q92623 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC9Q92623 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC9Q92623 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC9Q92623 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC9Q92623 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC9Q92623 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC9Q92623 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC9Q92623 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC9Q92623 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC9Q92623 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC9Q92623 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC9Q92623 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC9Q92623 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC9Q92623 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC9Q92623 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC9Q92623 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC9Q92623 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC9Q92623 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC9Q92623 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms