Protein–RNA interactions for Protein: Q92393

TY1B-OR, Transposon Ty1-OR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ORQ92393 MTD1YKR080W 963 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 YPL041CYPL041C 624 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 EMP47YFL048C 1338 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 UPC2YDR213W 2742 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 YMR114CYMR114C 1107 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 EFM2YBR271W 1260 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 NOC4YPR144C 1659 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 ERG5YMR015C 1617 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 HOS2YGL194C 1359 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 YDL121CYDL121C 450 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 IMP2YMR035W 534 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 POP4YBR257W 840 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 UBP9YER098W 2265 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 TFC7YOR110W 1308 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 AIM3YBR108W 2844 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 FAT1YBR041W 2010 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 CHL1YPL008W 2586 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 EHD3YDR036C 1503 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 OPT1YJL212C 2400 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 YHR112CYHR112C 1137 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 OPY2YPR075C 1083 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 RDS1YCR106W 2499 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 HOYDL227C 1761 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 RPG1YBR079C 2895 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 PAU10YDR542W 363 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 RMR1YGL250W 726 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 PAU11YGL261C 363 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 PAU13YHL046C 363 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 PAU4YLR461W 363 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 HMG1YML075C 3165 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 VID22YLR373C 2706 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 DBP10YDL031W 2988 nt5.71□□□□□ -1.49
TY1B-ORQ92393 YEL057CYEL057C 702 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 TPA1YER049W 1935 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 HRK1YOR267C 2280 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 ECT1YGR007W 972 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 RIB4YOL143C 510 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 GLT1YDL171C 6438 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 FRE3YOR381W 2136 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 GCD14YJL125C 1152 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 MYO5YMR109W 3660 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 VHS3YOR054C 2025 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 SWH1YAR042W 3567 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 YEL045CYEL045C 426 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 HUT1YPL244C 1020 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 RKM2YDR198C 1440 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 NBP2YDR162C 711 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 MDJ2YNL328C 441 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 NUG1YER006W 1563 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 OCA2YNL056W 594 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 TOG1YER184C 2385 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 ROG3YFR022W 2202 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 COX11YPL132W 903 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1B-ORQ92393 PMT2YAL023C 2280 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 ELF1YKL160W 438 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 AHP1YLR109W 531 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 YPL025CYPL025C 558 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 CST6YIL036W 1764 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 snR7-LsnR7-L 214 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 ECM8YBR076W 1065 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 JIP4YDR475C 2631 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 NSI1YDR026C 1713 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 PMT6YGR199W 2280 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 OPI6YDL096C 327 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 IRC25YLR021W 540 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 MOH1YBL049W 417 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 COG5YNL051W 1212 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 PDR16YNL231C 1056 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 RFC3YNL290W 1023 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 DBF4YDR052C 2115 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 MTC4YBR255W 2085 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 RRN3YKL125W 1884 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 PTM1YKL039W 1572 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 FDH1YOR388C 1131 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 NCR1YPL006W 3513 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 FDH2YPL275W 711 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 SPT10YJL127C 1923 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 PHO84YML123C 1764 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 DSF2YBR007C 2211 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 URA3YEL021W 804 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 PHA2YNL316C 1005 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 OSW1YOR255W 837 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 YGR139WYGR139W 339 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 ECM4YKR076W 1113 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 ACK1YDL203C 1872 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 STE13YOR219C 2796 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 DTD1YDL219W 453 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 YLR012CYLR012C 300 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 SIW14YNL032W 846 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 YER076CYER076C 909 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 CDC45YLR103C 1953 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1B-ORQ92393 ISR1YPR106W 1332 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1B-ORQ92393 MSC7YHR039C 1935 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1B-ORQ92393 RRN6YBL014C 2685 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1B-ORQ92393 YPP1YGR198W 2454 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1B-ORQ92393 RPA43YOR340C 981 nt5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 130.6 ms