Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CTTNBP2Q8WZ74 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CTTNBP2Q8WZ74 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms