Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC107Q8WV48 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms