Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTRT1Q8TDG2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms