Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHDC9Q8NEP7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHDC9Q8NEP7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHDC9Q8NEP7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHDC9Q8NEP7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC9Q8NEP7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC9Q8NEP7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC9Q8NEP7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC9Q8NEP7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC9Q8NEP7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHDC9Q8NEP7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.6
KLHDC9Q8NEP7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms