Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MFSD2AQ8NA29 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD2AQ8NA29 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD2AQ8NA29 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms