Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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RNF148Q8N7C7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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RNF148Q8N7C7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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RNF148Q8N7C7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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RNF148Q8N7C7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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RNF148Q8N7C7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF148Q8N7C7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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