Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC170Q8IYT3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC170Q8IYT3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms