Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FUNDC1Q8IVP5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FUNDC1Q8IVP5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms