Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTF1AQ7RTS3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTF1AQ7RTS3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms