Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
HECW1Q76N89 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms