Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms