Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SRCAPQ6ZRS2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms