Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDZRN4Q6ZMN7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN4Q6ZMN7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms