Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF7IPQ6VMQ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATF7IPQ6VMQ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF7IPQ6VMQ6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms