Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L3Q6VB84 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms