Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA2Q69YH5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms