Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUPD1Q68J44 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms