Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CARMIL1Q5VZK9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms