Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms