Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms