Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SDK2Q58EX2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms