Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC153Q494R4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC153Q494R4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms