Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ9

DEFB110, Beta-defensin 110, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB110Q30KQ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DEFB110Q30KQ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFB110Q30KQ9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms