Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms