Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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SSX1Q16384 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SSX1Q16384 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX1Q16384 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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SSX1Q16384 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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SSX1Q16384 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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SSX1Q16384 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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SSX1Q16384 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SSX1Q16384 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSX1Q16384 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SSX1Q16384 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSX1Q16384 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SSX1Q16384 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SSX1Q16384 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSX1Q16384 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SSX1Q16384 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSX1Q16384 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSX1Q16384 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSX1Q16384 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSX1Q16384 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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