Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETDB1Q15047 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETDB1Q15047 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms