Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX17Q15036 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX17Q15036 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX17Q15036 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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