Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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IRF3Q14653 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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IRF3Q14653 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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IRF3Q14653 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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IRF3Q14653 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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IRF3Q14653 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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IRF3Q14653 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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IRF3Q14653 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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IRF3Q14653 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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IRF3Q14653 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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IRF3Q14653 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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IRF3Q14653 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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IRF3Q14653 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF3Q14653 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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