Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNFAIP1Q13829 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP1Q13829 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
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