Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR1Q13613 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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