Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN3Q13286 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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