Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA1Q13131 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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PRKAA1Q13131 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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