Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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