Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TFCP2Q12800 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TFCP2Q12800 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TFCP2Q12800 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TFCP2Q12800 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TFCP2Q12800 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TFCP2Q12800 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TFCP2Q12800 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TFCP2Q12800 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TFCP2Q12800 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TFCP2Q12800 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TFCP2Q12800 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TFCP2Q12800 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TFCP2Q12800 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TFCP2Q12800 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TFCP2Q12800 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TFCP2Q12800 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TFCP2Q12800 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TFCP2Q12800 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TFCP2Q12800 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TFCP2Q12800 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TFCP2Q12800 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TFCP2Q12800 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TFCP2Q12800 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TFCP2Q12800 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TFCP2Q12800 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TFCP2Q12800 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TFCP2Q12800 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TFCP2Q12800 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TFCP2Q12800 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TFCP2Q12800 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TFCP2Q12800 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TFCP2Q12800 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TFCP2Q12800 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TFCP2Q12800 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFCP2Q12800 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TFCP2Q12800 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFCP2Q12800 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFCP2Q12800 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFCP2Q12800 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFCP2Q12800 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFCP2Q12800 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFCP2Q12800 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TFCP2Q12800 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFCP2Q12800 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TFCP2Q12800 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFCP2Q12800 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFCP2Q12800 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFCP2Q12800 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFCP2Q12800 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFCP2Q12800 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFCP2Q12800 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFCP2Q12800 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TFCP2Q12800 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TFCP2Q12800 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TFCP2Q12800 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.52■■■□□ 2
TFCP2Q12800 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFCP2Q12800 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFCP2Q12800 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TFCP2Q12800 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFCP2Q12800 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2Q12800 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2Q12800 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2Q12800 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2Q12800 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2Q12800 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2Q12800 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2Q12800 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2Q12800 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFCP2Q12800 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFCP2Q12800 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
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