Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 GUP2YPL189W 1830 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 URK1YNR012W 1506 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YGR054WYGR054W 1929 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 GSH2YOL049W 1476 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YML133CYML133C 4125 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 PRP24YMR268C 1335 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 LAT1YNL071W 1449 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 BUG1YDL099W 1026 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 RPL24AYGL031C 468 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 LYS1YIR034C 1122 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YJR141WYJR141W 1044 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YKL102CYKL102C 306 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YAR064WYAR064W 300 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 VPS71YML041C 843 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 GTO3YMR251W 1101 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 RUF23RUF23 254 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 COS1YNL336W 1146 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 RPS9BYBR189W 588 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 RSC58YLR033W 1509 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YBR284WYBR284W 2394 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YDL023CYDL023C 321 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 MRPL35YDR322W 1104 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 MRF1YGL143C 1242 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 CIA2YHR122W 696 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 COA1YIL157C 594 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 LCB3YJL134W 1230 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YJL147CYJL147C 1149 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 COX15YER141W 1461 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 TRP3YKL211C 1455 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 GAS5YOL030W 1455 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 VPS30YPL120W 1674 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 NTE1YML059C 5040 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 COX9YDL067C 180 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 MEI4YER044C-A 1227 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 QCR6YFR033C 444 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 SDT1YGL224C 843 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YHR095WYHR095W 495 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 ZIM17YNL310C 525 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 MRP51YPL118W 1035 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 OXR1YPL196W 822 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 BUD22YMR014W 1560 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 NOC4YPR144C 1659 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YFL040WYFL040W 1623 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 ARE2YNR019W 1929 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 CLB3YDL155W 1284 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 MRPL7YDR237W 879 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YGL204CYGL204C 306 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 CYC1YJR048W 330 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YAR053WYAR053W 297 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 RNA1YMR235C 1224 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 MCA1YOR197W 1299 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 DGA1YOR245C 1257 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 ACF2YLR144C 2340 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 TYR1YBR166C 1359 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 MST27YGL051W 705 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YGR064WYGR064W 369 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 GRE3YHR104W 984 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 MST28YAR033W 705 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 COQ9YLR201C 783 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 MIX23YBL107C 591 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 VPS21YOR089C 633 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 PRM3YPL192C 402 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 ECM31YBR176W 939 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 PRY3YJL078C 2646 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 TIM54YJL054W 1437 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YIL055CYIL055C 1884 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 DBP9YLR276C 1785 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 LCB2YDR062W 1686 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 STP4YDL048C 1473 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 HRQ1YDR291W 3234 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YDL183CYDL183C 963 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 VMA3YEL027W 483 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 MEH1YKR007W 555 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 RIM11YMR139W 1113 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 RPL3YOR063W 1164 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 YOR199WYOR199W 330 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 CTF19YPL018W 1110 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 PRM2YIL037C 1971 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 ADY3YDL239C 2373 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 RGD1YBR260C 2001 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 NSI1YDR026C 1713 nt5.71□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 URA7YBL039C 1740 nt5.71□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 SIR1YKR101W 1965 nt5.71□□□□□ -1.49
TY1A-NL1Q12391 KRE29YER038C 1395 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 DUN1YDL101C 1542 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 CRH1YGR189C 1524 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 UGX2YDL169C 672 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YER165C-AYER165C-A 357 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 OST5YGL226C-A 261 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 SCM4YGR049W 564 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YIR042CYIR042C 711 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 MTW1YAL034W-A 870 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YKL023WYKL023W 834 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 RPR1RPR1 369 nt5.71□□□□□ -1.5
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