Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 RSM10YDR041W 612 nt4.94□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 YGR269WYGR269W 327 nt4.94□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 BIO2YGR286C 1128 nt4.94□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 SIW14YNL032W 846 nt4.94□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 PCL1YNL289W 840 nt4.94□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 ECM23YPL021W 564 nt4.94□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 MEC3YLR288C 1425 nt4.94□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 THI7YLR237W 1797 nt4.93□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 LCB2YDR062W 1686 nt4.93□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 YIL171WYIL171W 330 nt4.93□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 SPC24YMR117C 642 nt4.93□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 NOP13YNL175C 1212 nt4.93□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 FRE7YOL152W 1863 nt4.93□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 HSP26YBR072W 645 nt4.93□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 OPY2YPR075C 1083 nt4.93□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 NOC2YOR206W 2133 nt4.93□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 MET12YPL023C 1974 nt4.93□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 LAS21YJL062W 2493 nt4.92□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 YPK9YOR291W 4419 nt4.92□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 PHO84YML123C 1764 nt4.92□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 YEL028WYEL028W 462 nt4.92□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 DAM1YGR113W 1032 nt4.92□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.92□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.92□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 PEX12YMR026C 1200 nt4.92□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 YMR085WYMR085W 1299 nt4.92□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 YND1YER005W 1893 nt4.92□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 SRO7YPR032W 3102 nt4.92□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 ARG4YHR018C 1392 nt4.91□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 MPC54YOR177C 1395 nt4.91□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 CAB4YGR277C 918 nt4.91□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 RPL14AYKL006W 417 nt4.91□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 YBL059WYBL059W 582 nt4.91□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 NCE103YNL036W 666 nt4.91□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 STE12YHR084W 2067 nt4.91□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 RIA1YNL163C 3333 nt4.91□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 MST1YKL194C 1389 nt4.91□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 SAS4YDR181C 1446 nt4.9□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 HSP42YDR171W 1128 nt4.9□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 CIA2YHR122W 696 nt4.9□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 MAC1YMR021C 1254 nt4.9□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 SHE1YBL031W 1017 nt4.9□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 ELA1YNL230C 1140 nt4.9□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 snR34snR34 203 nt4.9□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 THS1YIL078W 2205 nt4.9□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 VMA1YDL185W 3216 nt4.89□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 RRN11YML043C 1524 nt4.89□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 ATG1YGL180W 2694 nt4.89□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 ARP10YDR106W 855 nt4.89□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 YLL017WYLL017W 312 nt4.89□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 CUZ1YNL155W 825 nt4.89□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 MGR2YPL098C 342 nt4.89□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 GIP1YBR045C 1920 nt4.88□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 RTN1YDR233C 888 nt4.88□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 YMR114CYMR114C 1107 nt4.88□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 OSW5YMR148W 447 nt4.88□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 ORC6YHR118C 1308 nt4.88□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 MDM30YLR368W 1797 nt4.88□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 GCR1YPL075W 2358 nt4.87□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 MMT1YMR177W 1533 nt4.87□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 RFT1YBL020W 1725 nt4.87□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 snR57snR57 88 nt4.87□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 KIN28YDL108W 921 nt4.87□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 SKI8YGL213C 1194 nt4.87□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 YGR122WYGR122W 1209 nt4.87□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 HPM1YIL110W 1134 nt4.87□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 FMP46YKR049C 402 nt4.87□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 VTA1YLR181C 993 nt4.87□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 YBL029WYBL029W 1131 nt4.87□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 VHS3YOR054C 2025 nt4.87□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 MRE11YMR224C 2079 nt4.87□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 PHM7YOL084W 2976 nt4.86□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 ADD66YKL206C 804 nt4.86□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 NDJ1YOL104C 1059 nt4.86□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 RPS19AYOL121C 435 nt4.86□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 PDX3YBR035C 687 nt4.86□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 GCR2YNL199C 1605 nt4.86□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 COQ4YDR204W 1008 nt4.85□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 CNL1YDR357C 369 nt4.85□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 JAC1YGL018C 555 nt4.85□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 EDC1YGL222C 528 nt4.85□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 FSH3YOR280C 801 nt4.85□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 ALD3YMR169C 1521 nt4.85□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 ALD2YMR170C 1521 nt4.85□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 TRS85YDR108W 2097 nt4.85□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 DHH1YDL160C 1521 nt4.84□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 TRM11YOL124C 1302 nt4.84□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 NBP2YDR162C 711 nt4.84□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 SNM1YDR478W 597 nt4.84□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 SPO74YGL170C 1242 nt4.84□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 YLF2YHL014C 1218 nt4.84□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 MSA2YKR077W 1092 nt4.84□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 RGS2YOR107W 930 nt4.84□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 FES1YBR101C 873 nt4.84□□□□□ -1.63
LSP1Q12230 SSH4YKL124W 1740 nt4.83□□□□□ -1.64
LSP1Q12230 CTF18YMR078C 2226 nt4.83□□□□□ -1.64
LSP1Q12230 EFB1YAL003W 621 nt4.83□□□□□ -1.64
LSP1Q12230 ATG33YLR356W 594 nt4.83□□□□□ -1.64
LSP1Q12230 HEK2YBL032W 1146 nt4.83□□□□□ -1.64
LSP1Q12230 TOM40YMR203W 1164 nt4.83□□□□□ -1.64
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