Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 CEG1YGL130W 1380 nt4.68□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 RTN1YDR233C 888 nt4.68□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 DAM1YGR113W 1032 nt4.68□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 YAR023CYAR023C 540 nt4.68□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 PEP4YPL154C 1218 nt4.68□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 ANT1YPR128C 987 nt4.68□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 MDR1YGR100W 2853 nt4.68□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 ORC6YHR118C 1308 nt4.68□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 PCL9YDL179W 915 nt4.67□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 CPR6YLR216C 1116 nt4.67□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 PDX3YBR035C 687 nt4.67□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 YPR015CYPR015C 744 nt4.67□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 MOT2YER068W 1764 nt4.67□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 ZPR1YGR211W 1461 nt4.67□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 SSH4YKL124W 1740 nt4.66□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 MSC2YDR205W 2175 nt4.66□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 YDL124WYDL124W 939 nt4.66□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 MNN11YJL183W 1269 nt4.66□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 YNK1YKL067W 462 nt4.66□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 VTA1YLR181C 993 nt4.66□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 ICY2YPL250C 411 nt4.66□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 YDR444WYDR444W 2064 nt4.66□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 PSY4YBL046W 1326 nt4.66□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 LAP3YNL239W 1365 nt4.65□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 MPS3YJL019W 2049 nt4.65□□□□□ -1.66
VPS54Q12071 RTC1YOL138C 4026 nt4.65□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YEL045CYEL045C 426 nt4.65□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt4.65□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YKR047WYKR047W 306 nt4.65□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 RPS31YLR167W 459 nt4.65□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YNL057WYNL057W 333 nt4.65□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 SPS19YNL202W 879 nt4.65□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 MRM1YOR201C 1239 nt4.65□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YPL114WYPL114W 420 nt4.65□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YPL278CYPL278C 303 nt4.65□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 snR19snR19 568 nt4.65□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 REI1YBR267W 1182 nt4.65□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 PAN1YIR006C 4443 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 COS4YFL062W 1140 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YIL165CYIL165C 360 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 RFC2YJR068W 1062 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 COS3YML132W 1140 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 MVD1YNR043W 1191 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 SPO19YPL130W 672 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YPR071WYPR071W 636 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 COS2YBR302C 1140 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 EUG1YDR518W 1554 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 PDR15YDR406W 4590 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 KAP114YGL241W 3015 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 MPC54YOR177C 1395 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 GGA1YDR358W 1674 nt4.64□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 IKS1YJL057C 2004 nt4.63□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YND1YER005W 1893 nt4.63□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 LSM6YDR378C 261 nt4.63□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 PIC2YER053C 903 nt4.63□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.63□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 RAI1YGL246C 1164 nt4.63□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YGR273CYGR273C 525 nt4.63□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YNL217WYNL217W 981 nt4.63□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 DPH6YLR143W 2058 nt4.63□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 HNT2YDR305C 654 nt4.62□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 LYS5YGL154C 819 nt4.62□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.62□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 BBC1YJL020C 3474 nt4.62□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 ISR1YPR106W 1332 nt4.62□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 GAS4YOL132W 1416 nt4.62□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YPL260WYPL260W 1656 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 PMT4YJR143C 2289 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 TCM62YBR044C 1719 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 OCT1YKL134C 2319 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YFL068WYFL068W 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 LSO1YJR005C-A 282 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 DAN1YJR150C 897 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 SKG1YKR100C 1068 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 TAF4YMR005W 1167 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 TPP1YMR156C 717 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 MET12YPL023C 1974 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 VID22YLR373C 2706 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 SAS4YDR181C 1446 nt4.61□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 RGP1YDR137W 1992 nt4.6□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 SIR1YKR101W 1965 nt4.6□□□□□ -1.67
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