Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 OMS1YDR316W 1416 nt5.21□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 ISR1YPR106W 1332 nt5.21□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 ZPR1YGR211W 1461 nt5.2□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 VTA1YLR181C 993 nt5.2□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 JHD2YJR119C 2187 nt5.2□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 SAS4YDR181C 1446 nt5.2□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 FLC1YPL221W 2382 nt5.2□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 MPC54YOR177C 1395 nt5.19□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 FPK1YNR047W 2682 nt5.19□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt5.19□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 PFA5YDR459C 1125 nt5.19□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 IRC22YEL001C 678 nt5.19□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 HPM1YIL110W 1134 nt5.19□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 NRG2YBR066C 663 nt5.19□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 MDR1YGR100W 2853 nt5.18□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 YHR177WYHR177W 1362 nt5.18□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 PCL9YDL179W 915 nt5.18□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 GLE2YER107C 1098 nt5.18□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 NVJ1YHR195W 966 nt5.18□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 YNR068CYNR068C 819 nt5.18□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 YGR125WYGR125W 3111 nt5.17□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 CNN1YFR046C 1086 nt5.17□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 ERV14YGL054C 417 nt5.17□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 SMA1YPL027W 738 nt5.17□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 YIL001WYIL001W 1542 nt5.17□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 MOB2YFL034C-B 864 nt5.16□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.16□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 TEF4YKL081W 1239 nt5.16□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 YAR061WYAR061W 204 nt5.16□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 YIM1YMR152W 1098 nt5.16□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 MFA2YNL145W 117 nt5.16□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 CTR1YPR124W 1221 nt5.16□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 SUE1YPR151C 621 nt5.16□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 COP1YDL145C 3606 nt5.16□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 DEG1YFL001W 1329 nt5.16□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 NGL2YMR285C 1548 nt5.15□□□□□ -1.58
CTI6Q08923 NPY1YGL067W 1155 nt5.15□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 YJR038CYJR038C 363 nt5.15□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 RPS0BYLR048W 759 nt5.15□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 VPS68YOL129W 555 nt5.15□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 ECM33YBR078W 1290 nt5.15□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 snR32snR32 188 nt5.15□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 ARC40YBR234C 1155 nt5.15□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 MCM4YPR019W 2802 nt5.15□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 MET17YLR303W 1335 nt5.15□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 MIF2YKL089W 1650 nt5.15□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 PAH1YMR165C 2589 nt5.14□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 PAN1YIR006C 4443 nt5.14□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 KCH1YJR054W 1494 nt5.14□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 snR57snR57 88 nt5.14□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 YFR035CYFR035C 345 nt5.14□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 PRM9YAR031W 897 nt5.14□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 MSK1YNL073W 1731 nt5.14□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 PRD1YCL057W 2139 nt5.14□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 SWC3YAL011W 1878 nt5.13□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 LSM6YDR378C 261 nt5.13□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 YEL045CYEL045C 426 nt5.13□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 YLR036CYLR036C 612 nt5.13□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 SNO1YMR095C 675 nt5.13□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 ROT1YMR200W 771 nt5.13□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 CDC21YOR074C 915 nt5.13□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 MET16YPR167C 786 nt5.13□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 YDL109CYDL109C 1944 nt5.13□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 EKI1YDR147W 1605 nt5.12□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 THI22YPR121W 1719 nt5.12□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 ARN2YHL047C 1863 nt5.12□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 UBC1YDR177W 648 nt5.12□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 YDR282CYDR282C 1245 nt5.12□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 DSD1YGL196W 1287 nt5.12□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt5.12□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 MCM1YMR043W 861 nt5.12□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 SPC24YMR117C 642 nt5.12□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 CAB3YKL088W 1716 nt5.11□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 MNN4YKL201C 3537 nt5.11□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 PHM8YER037W 966 nt5.11□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 YGR122WYGR122W 1209 nt5.11□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 RPS31YLR167W 459 nt5.11□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 CSR1YLR380W 1227 nt5.11□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 SAS10YDL153C 1833 nt5.11□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 RSC58YLR033W 1509 nt5.1□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 CPR6YLR216C 1116 nt5.1□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 GAS2YLR343W 1668 nt5.1□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 TIF34YMR146C 1044 nt5.1□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 SRB6YBR253W 366 nt5.1□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5.1□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 AKL1YBR059C 3327 nt5.1□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.09□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 MNN11YJL183W 1269 nt5.09□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 PEX12YMR026C 1200 nt5.09□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 ANT1YPR128C 987 nt5.09□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 CKS1YBR135W 453 nt5.09□□□□□ -1.59
CTI6Q08923 PMT5YDL093W 2232 nt5.08□□□□□ -1.6
CTI6Q08923 MRPL7YDR237W 879 nt5.08□□□□□ -1.6
CTI6Q08923 CAF16YFL028C 870 nt5.08□□□□□ -1.6
CTI6Q08923 YGR273CYGR273C 525 nt5.08□□□□□ -1.6
CTI6Q08923 EFB1YAL003W 621 nt5.08□□□□□ -1.6
CTI6Q08923 FBP1YLR377C 1047 nt5.08□□□□□ -1.6
CTI6Q08923 SEO1YAL067C 1782 nt5.08□□□□□ -1.6
CTI6Q08923 IMD2YHR216W 1572 nt5.08□□□□□ -1.6
CTI6Q08923 LDB17YDL146W 1476 nt5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.5 ms