Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4F3Q08477 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4F3Q08477 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms