Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	YMR221C	YMR221C	1515 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	ZPR1	YGR211W	1461 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	OMS1	YDR316W	1416 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	FRT2	YAL028W	1587 nt		5.04	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	TFG1	YGR186W	2208 nt		5.04	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	RMI1	YPL024W	726 nt		5.04	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	snR19	snR19	568 nt		5.04	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	PEX29	YDR479C	1665 nt		5.04	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	TPO2	YGR138C	1845 nt		5.04	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	RAD57	YDR004W	1383 nt		5.04	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	FOX2	YKR009C	2703 nt		5.03	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	RIP1	YEL024W	648 nt		5.03	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	AIM41	YOR215C	558 nt		5.03	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	ISA2	YPR067W	558 nt		5.03	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	RER1	YCL001W	567 nt		5.03	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	MDM34	YGL219C	1380 nt		5.03	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	SWC3	YAL011W	1878 nt		5.03	□□□□□ -1.6
MRD1	Q06106	BUR6	YER159C	429 nt		5.02	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	YGL118C	YGL118C	438 nt		5.02	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	YLR124W	YLR124W	345 nt		5.02	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	BUD17	YNR027W	954 nt		5.02	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	CAB3	YKL088W	1716 nt		5.02	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	ALG2	YGL065C	1512 nt		5.02	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	GDH2	YDL215C	3279 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	DIT2	YDR402C	1470 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	HXT7	YDR342C	1713 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	HXT6	YDR343C	1713 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	TRM44	YPL030W	1704 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	SAS4	YDR181C	1446 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	PFA5	YDR459C	1125 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	PSR1	YLL010C	1284 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	VTA1	YLR181C	993 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	YNL181W	YNL181W	1224 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	YPL073C	YPL073C	486 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	VID22	YLR373C	2706 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	HUL4	YJR036C	2679 nt		5	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	YDL183C	YDL183C	963 nt		5	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	YFT2	YDR319C	825 nt		5	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	RNA15	YGL044C	891 nt		5	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	NVJ1	YHR195W	966 nt		5	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	SPN1	YPR133C	1233 nt		5	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	YER158C	YER158C	1722 nt		5	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	ISR1	YPR106W	1332 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	YDL109C	YDL109C	1944 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	THI20	YOL055C	1656 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	TIF4632	YGL049C	2745 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	COQ4	YDR204W	1008 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tL(UAG)J	tL(UAG)J	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tL(UAG)L1	tL(UAG)L1	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tL(UAG)L2	tL(UAG)L2	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	GPP1	YIL053W	753 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	CTR1	YPR124W	1221 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	YCL021W-A	YCL021W-A	378 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	IMD2	YHR216W	1572 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	PRP28	YDR243C	1767 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	DEG1	YFL001W	1329 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	FLO8	YER109C	2400 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	PHM7	YOL084W	2976 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	PCL9	YDL179W	915 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	ERV14	YGL054C	417 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	TYS1	YGR185C	1185 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	FMP46	YKR049C	402 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	RPS0B	YLR048W	759 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	NRG2	YBR066C	663 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	MPC54	YOR177C	1395 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	JHD2	YJR119C	2187 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	ADY3	YDL239C	2373 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	GCR1	YPL075W	2358 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	YDR261C-D	YDR261C-D	4815 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	YDL124W	YDL124W	939 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	NUP42	YDR192C	1293 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tK(CUU)C	tK(CUU)C	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tK(CUU)D1	tK(CUU)D1	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tK(CUU)D2	tK(CUU)D2	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tK(CUU)E1	tK(CUU)E1	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tK(CUU)E2	tK(CUU)E2	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tK(CUU)F	tK(CUU)F	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tK(CUU)G1	tK(CUU)G1	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tK(CUU)G2	tK(CUU)G2	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tK(CUU)G3	tK(CUU)G3	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tK(CUU)I	tK(CUU)I	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tK(CUU)J	tK(CUU)J	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tK(CUU)K	tK(CUU)K	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tK(CUU)M	tK(CUU)M	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	tK(CUU)P	tK(CUU)P	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	MOB2	YFL034C-B	864 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	NKP2	YLR315W	462 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	YNR068C	YNR068C	819 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	RRP40	YOL142W	723 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	YIL001W	YIL001W	1542 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRD1	Q06106	snR57	snR57	88 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MRD1	Q06106	MFA2	YNL145W	117 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MRD1	Q06106	PDX3	YBR035C	687 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MRD1	Q06106	RIM21	YNL294C	1602 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MRD1	Q06106	SUL2	YLR092W	2682 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MRD1	Q06106	THS1	YIL078W	2205 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MRD1	Q06106	ADP1	YCR011C	3150 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MRD1	Q06106	HFA1	YMR207C	6372 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MRD1	Q06106	SAS10	YDL153C	1833 nt		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.8 ms