Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPN12Q05209 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms